据韩国独立新闻媒体《韩民族日报》The Hankyoreh(以下简称TH)报道,早在2009年赵镛基名义退休后,就开始有纯福音教会的长老对其家人渎职及将教会财产占为己有的行为进行控诉。当时的韩国基督教教会改革联盟(Christian Alliance for Church Reform)曾就这些指控询问赵镛基牧师。然而赵请求调查人员将这些控诉搁置三年,他承诺将在三年内让其家人与教会划清界限。
1992年至1998年,赵镛基担任The Church Mission Society主席期间,向教会支取了相当于1亿5千2百万美元的资金,兴建“社区媒体中心大楼CCMM-The Center of Communities and Mass Media”。 这一笔借款,赵只归还教会6千万,尚有9千万未曾归还。
和赵镛基牧师有着四十多年好友关系的Bob Rodgers(Church Growth International of the Americas的总裁)曾接受美国《今日基督教》杂志记者采访时,为赵镛基辩解:“尽管他创办了世界上最大的教会,有近100万信徒,但他本人过着简单的生活,而且他透过筹款和个人捐赠,曾给教会提供了1.7多亿美金的奉献。”
Bob Rodgers接受《境界》记者采访时,提到他曾劝赵镛基去美国待一段时间离开这些是非,但赵拒绝,认为他的家庭正处于一场属灵征战中,他的两个小儿子在教会服事很有果效,他的妻子也在大学服事,如果赵离开,他们的职位都将被撤销,他试图保护他的家人。